近内海的鱼、虾、贝、藻、蟹等有千余种，是全省重要渔区。海洋捕捞主要种类：大黄鱼、带鱼、海鳗、鲳鱼、马鲛、牡蛎、对虾、毛虾、梭子蟹、海带、紫菜等，占海洋渔业产量50%以上。名贵种类有石斑鱼、海蚌、鲍、竹蛏等。水产养殖主要种类：石斑鱼、对虾、缢蛏、花蛤、牡蛎、贻贝、海带、紫菜等。长乐漳港海蚌享誉全国。海域中叶绿素平均含量0.6～3.1毫克／立方米，初级生产力日平均291毫克／平方米。饵料生物丰富，浮游植物平均总量180毫克／立方米。

福州市发现的矿藏有56种。探明储量并列入矿产资源储量表的有：金、银、软锰矿、褐铁矿、饰面用花岗岩、饰面用辉绿岩、铸型用砂、水泥标准砂、玻璃用砂、建筑用砂、高岭土、叶蜡石、明矾石、冶金用脉石英、泥炭、地热水等15种；未列入矿产资源储量表的有：寿山石、砖瓦用粘土、建筑用花岗石、建筑用凝灰岩以及矿泉水等。全市有矿产地129处。其中大型矿床11处，即晋安区峨嵋、寿山和福清东仔的叶蜡石，福清海亮、罗源白岩的花岗石，平潭芦洋埔的标准砂，长乐文武砂、平潭竹屿—长江澳的铸型用砂，闽侯厚美—马江的建筑用砂，福州地热，平潭水源地；中型矿床9处，即闽清珠中的叶蜡石、高岭土，闽侯青口东台、平潭后楼花岗石，福州鳌峰洲水源地，以及未列入储量表的4处；小型矿床109处。金、银、石英砂、花岗石、叶蜡石、明矾石、高岭土等矿产，潜在经济价值达422亿元。

开发利用的有地热、高岭土、建筑用花岗石、建筑用凝灰岩、建筑用砂、矿泉水、饰面用花岗岩、饰面用辉绿岩、玄武岩、冶金用脉石英、叶蜡石(含寿山石)、铸型用砂、玻璃用砂、砖瓦用粘土等14种矿藏。