元朝福州建置，中央设中书省，地方设行中书省，下设路、州、县。至元十五年（1278年）改福安府为福州路，辖闽县、侯官、怀安、古田、福清、闽清、长乐、连江、罗源、永福、长溪、福安、宁德十三县，侯官为路的驻地。十七年（1280年）置福建行中书省于福州。二十三年（1286年）将长溪县升格为福宁州，辖宁德、福安二县；元贞元年（1295年）将福清县升格为州。