明朝福州建置，明初改路为府。洪武元年（1368年）改为福州府，属福建布政使司。二年（1369年）福清、福宁二州降格为县，又辖闽县、侯官、怀安、古田、闽清、长乐、连江、罗源、永福、福清、福宁、宁德、福安十三县。成化九年（1473年）把福宁县分出并升格为直隶州，把宁德、福安二县归其管辖。万历八年（1580年）怀安县并入侯官县。