1月1日，福州启动医疗保险机制。到2008年，医疗保险定点医疗机构和定点零售药店已达331家和291家。

1月2日，马祖客轮首次直航马尾；8月2日，马尾客轮首次直航马祖。“两马”航线正式开通。

1月15日，位于平潭的中国标准砂厂通过ISO14001环境管理体系认证，成为福州市首家获得进入国际市场“绿色通行证”的工业企业。

同日，国家旅游局命名福州为第二批中国优秀旅游城市。福州国家森林公园被批准为首批AAAA旅游区（点）。

同日，福州马尾建设全国最大酶制剂基地，首期投资2000万元。

2月9日，香港恒生银行福州分行正式开业。这是首家在榕落户的港资银行。

2月10日，马祖水部尚公府平安民俗文化交流团乘坐直航客轮抵福州旅游。

2月25日 福州市人大十一届四次会议审议通过《福州市国民经济和社会发展第十个五年计划纲要》。

3月1日，梅坎铁路通车，福州－深圳首次直通火车，这是当时福州地区到珠江三角地区最为便捷的铁路直通列车。

3月4日，通过国际青年基金会项目认定的福州屏西婴幼儿亲子学苑正式挂牌，是全国首家婴幼儿亲子学苑。

4月3日，由海峡两岸同胞共同兴建的琴江中法海战烈士陵园竣工揭牌。

4月13日，在杭州举行的全国冠军游泳赛上，福州籍运动员齐晖以2分22秒的成绩打破200米蛙泳世界纪录。

5月1日，福州金牛山公园建成开放。公园位于杨桥西路北侧的金牛山脉，占地面积63.3公顷。2000年12月15日正式动工兴建。

5月1～31日，福州市人民政府举办别具特色的首届福州美食节活动。

5月18日，福州市又一条滨江景观大道，南江滨大道动工。

同日，全省最大水产贝类批发市场——福州水产品贝类批发市场开业。

同日，全省首例以矿山采矿权为标的的罗源县岐余山矿公一号矿山采矿区拍卖。

同日，福州软件园产业基地服务中心大楼落成，中国电信1000兆宽带网正式开通。

5月18～25日，中国福州国际招商月暨第三届海峡科技成果交易会举行，本届突出“海峡”、“科技”、“旅游”三大主题，共签约392项，其中合同203项，合同外资7.71亿美元。

5月25日，福州市首个社区居委会－亚峰社区居委会成立。

6月17日，福州五一广场安装亚洲最大的彩屏模块。

6月28日，福州西湖湖区整治工程顺利竣工。

7月10日，省市共管、以市为主的福州市第一家本科大学——闽江学院在闽侯上街奠基建设。闽江大学由原福州师范高等专科学校与闽江职业大学合并成立。该学院为全日制公办本科大学。

7月21日，第三届北大－清华百年赛艇对抗赛在平潭举行，台湾海洋大学、辅仁大学首次组队参加。

同日，福州市举行首次客运出租车经营使用权拍卖会。拍卖新增的300辆出租车为期8年的经营使用权，其中豪华型270辆，超豪华型30辆，共有26家企业47组参加竞拍。这次拍卖经过9轮的激烈竞价，270辆豪华型出租车的经营使用权全部成交，成交总额5613万元。

8月1日，福州市人民政府颁布《福州市西湖、左海水域保护管理办法》，共19条。

9月3日，福州经济技术开发区成为我国第一个通过ISO14001（环境管理体系）认证的国家级开发区。

9月12日，福州首条自主航空邮路正式开通，与上海、北京等10条航空邮路形成中国自主集散式航空快速网。

9月20日，电视传记艺术片《冰心》和闽剧《画龙记》获第八届全国精神文明建设“五个一”工程奖。

9月30日，市第十一届人大常委会第二十七次会议任命练知轩为福州市代市长。

9月，何立峰当选中共福州市委书记。

10月1日，位于福清市东张镇少林村的南少林寺正式对社会开放。

同日，乌山立交桥竣工通车。该桥位于乌山路、白马路和环城路的交叉路口，为三层两个左转匝道定向互通立交桥。2001年4月开工修建，工程总投资1960万元。

10月16日，福州寿山石名列推荐国石榜首。11月14日被评为省石。

10月29日，福州剪纸艺人吴文娟首次获美国洛杉矶市政府颁发的艺术荣誉奖和加利福尼亚州颁发的艺术交流荣誉奖。

10月31日，数字化地震遥测台网建成并投入试观测，填补了福州地震监测技术的空白。

11月6～7日，中共福州市委七届十三次全体(扩大)会议通过《关于制定福州市国民经济和社会发展第十个五年计划的建议》，以及《关于从严治党若干问题的决定》。

11月16日，位于鼓屏路与鼓西路交界处工地的鼓楼遗址被发现，鼓楼是福州历史古城最重要的标志性建筑。

11月26日，福州市选送的闽剧《兰花赋》获2001年中国曹禺戏剧文学奖·剧目奖。

12月5日，《福州温泉志》出版发行，该志书记述了以福州市区温泉为重点的包括闽侯县、永泰县、闽清县、连江县、福清市等地温泉的分布范围、储藏介质、储量、水温、水质、水位、资源勘探程度、开发利用历史和现状、管理保护等方面内容。也是全国第一部记述温泉的书。

12月26日，福州市整体规模最大的义洲、帮洲旧屋改造工程启动。

是年，福州市全年实际利用外资为10.02亿美元，首次超过10亿美元。