侵入岩系指地下炽热岩浆侵入地壳内凝固而成的岩石。福州地区侵入岩分布广泛，岩体百余个，露布面积约占福州市陆域面积的30%。主要呈岩基、岩株、岩瘤和岩枝状产出。岩石类型多，岩性复杂，有基性、中性、中酸性和酸性等岩类。根据碱性氧化物含量，尚有碱性花岗岩。其中以酸性、中酸性岩类为主。这些侵入岩均属中生代燕山期多次侵入活动而形成，它们与具有同源、准同生关系的同期火山岩，都是环太平洋中、新生代岩浆活动的组成部分。按侵入活动时间顺序分为早、晚两期，其中以燕山晚期第三、四次活动最强烈、规模最大。较大的酸性、中酸性岩体有丹阳岩体、魁岐岩体、福州岩体、笔架山岩体、埔前岩体和三山岩体，中性岩体有莲花山岩体，基性岩体有官山岩体。

一、三山岩体

它为二长花岗岩体。沿北东向分布于福清市三山镇东壁岛、吉钓岛及平潭县屿头岛。岛间可能仍为本岩体，现被海水淹没及疏松沉积物覆盖。露布面积约80平方公里，呈岩株状产出。岩性为灰白色中粒黑云母二长花岗岩。地貌表现为低缓的丘陵。岩体在屿头岛过山村侵入南园组，在后洋村被石帽山群以喷发不整合覆盖。为燕山早期第一次侵入活动所形成，地质时代为晚侏罗世。

二、埔前岩体

它为花岗闪长岩体。以闽侯县荆溪镇埔前村为中心，略成北东向展布。出露面积约90平方公里，呈岩株状产出。岩石主要为灰白色中粒花岗闪长岩，向边缘过渡为浅肉红色花岗斑岩。反映在地貌上中心地势低洼，向边缘逐渐增高，呈盆地状。岩体在福州郊区的下寮村、闽侯的头村侵入南园组。为燕山早期第二次侵入活动所形成，地质时代属晚侏罗世。

三、莲花山岩体

它为闪长岩体。位于平潭县城东莲花山一带，呈南北向近长方形的小岩株状产出，出露面积约10平方公里。岩石主要为深灰、灰黑色中细粒辉石闪长岩、闪长岩。岩体结构和构造比较复杂，是一个复式侵入体。岩石易发生球状风化，地形呈缓坡丘陵，其北侧为石帽山群所覆盖。为燕山早期第二次侵入活动所形成。同位素年龄值为140百万年，地质时代为晚侏罗世。

四、官山岩体

它为辉长岩体。位于闽侯县南屿镇高岐村官山，出露面积仅0.33平方公里，呈北北东向似钟状的小岩瘤产出。由于周围被第四系所覆盖，岩体产状不清。岩石主要为深灰色块状辉长岩。地貌呈弧丘。为燕山晚期第一次侵入活动的早期所形成，地质时代属早白垩世。

五、丹阳岩体

它为二长花岗岩体。分布于以连江县丹阳镇为中心，东至马鼻镇，西抵罗源县飞竹乡，南起东湖镇，北达中房镇，露布面积约580平方公里，为福州地区出露面积最大的岩体。岩石主要为肉红色略显紫灰、紫色中粒含黑云母二长花岗岩。岩体西部边缘的矿物粒度由中粒变为细粒，形成边缘相。岩体于北、东部侵入南园组，西部侵入坂头组，南部为魁岐岩体和笔架山岩体所侵入。为燕山晚期第二次侵入活动所形成。同位素年龄值88.8百万年，地质时代为早白垩世。 　　

六、福州岩体

它为花岗岩体。分布于福州盆地及其周围低山丘陵，出露面积160平方公里，呈岩基状产出，在盆地内不少地方为第四系所覆盖。岩石主要为浅肉红色至灰白色中粒含黑云母花岗岩。岩体北部侵入南园组火山岩，东北部侵入燕山晚期第一次侵入岩体(官山岩体)，中部被魁岐岩体所侵入。为燕山晚期第三次侵入活动所形成。同位素年龄值为82.4～99百万年，地质时代属早白垩世。

七、魁岐岩体

它为复式花岗岩体。分布于福州市区东部魁岐及连江县一带，为长轴呈北北东向展布的矩形岩基，长26公里，宽12公里，出露面积300平方公里。由牛顶岩体(中粒花岗岩)、香炉岩体(碱性长石花岗岩)、快安岩体(碱性花岗岩)等岩性不同的约20个岩体组成。其中含钠闪石等碱性矿物的花岗岩被命名的碱性花岗岩，闻名于地质界。岩石主要为浅肉红色微带灰紫色中粒钾长花岗岩，以钾长石含量高(占64%～75%)、近直立的晶洞构造发育为特色。晶洞形态多样，大小不一，大者可达30～50厘米。岩体边缘相矿物粒度逐渐变细。岩石坚硬，节理发育，常形成怪石峥嵘的花岗岩石蛋地貌，呈现各种令人入胜的岩景。岩体多侵入南园组中，西南部侵入福州岩体中，东北部侵入丹阳岩体中，西北部被笔架山岩体所侵入。为燕山晚期第四次侵入活动所形成。同位素年龄值为86～91百万年，地质时代属晚白垩世。

八、笔架山岩体

它为花岗斑岩体。出露于连江县潘渡乡至安凯乡，以浦口镇的笔架山为中心，故名。呈北东东向带状展布，长50余公里，宽1～4公里，面积137.2平方公里，呈火岩墙状产出。岩石为浅肉红色至紫红色花岗班岩，氧化钾含量较高，局部可达7.68%。局部也有细小的晶洞构造。地貌反映多为丘陵。岩体于北部侵入南园组和丹阳岩体，东部侵入石帽山群，西部侵入魁岐岩体。为燕山晚期第五次侵入活动沿连江—福州断裂侵入而成，地质时代属晚白垩世。