福州市水资源十分丰富。闽江是全省最大的水系，发源于武夷山脉，在水口镇流入福州境内；自西北向东南流经闽清、闽侯、市区、长乐，分别从长门水道和梅花港水道注入东海。闽江全长530公里，在福州境内150公里；流域面积60992平方公里，在福州市境内8011.27平方公里。境内主要支流有安仁溪、梅溪、大樟溪、大目溪、新店溪、营前溪等。福州市区水道密布，主要有晋安河、白马河、光明港、安泰河等30多条内河，都与闽江沟通，水质良好。此外，连江县的主要水系是鳌江；福清市的主要水系是龙江。

　　福州市本地产水资源为101.59亿立方米，入境客水量达546.9亿立方米，总计水资源量为666.49亿立方米，人均水资源高达1.25万立方米。
 
闽江长门水道
    

　　闽江：系福建省第一大河，年径流量629亿立方米，居全国各大江河第七位。发源于武夷山脉东侧建宁县均口乡台田村严峰山西南坡，流经三明、南平两市和宁德地区古田县后，由水口镇入福州市境，流经闽清县、闽侯县，在侯官附近因受南台岛之阻，分为南、北两港，南港称乌龙江；北港称闽江，亦称台江或白龙江。北港绕过南台岛北侧，穿过福州市区至马尾港区，一般河宽300～600米，从淮安至罗星塔长28.5公里，河槽相对窄深，为航运通道。南港绕南台岛南侧，在江口处接纳大樟溪，江面宽阔，达3000～4000米，至峡兜缩小为500米，南港自淮安至罗星塔长40.2公里，河槽宽浅，为泄洪贮沙河段。南、北港于马尾港域汇后折向东北进入通海河段，经青洲、闽安峡谷（河宽由1700米缩小为600
米）至亭江长约12公里。在亭江附近受琅岐岛之阻，闽江复分为南、北两支：南支（称梅花水道）绕过琅岐岛南侧，经浮岐、潭头至梅花入东海，长18公里，河道宽浅；北支为闽江入海主汊，绕过琅岐岛的北侧经英屿、长安至琯头长门口，称长门水道，宽约1500米，深9～10米，长门峡谷宽仅380米，深达34米；出长门口后又被粗芦、川石、壶江诸岛分成乌猪水道、熨斗水道、壶江水道和川石水道分别入海，其中川石水道为主航道。
　　闽江径流年内分配不均，一月最小，平均流量为619立方米秒，而后逐月增大，6月最大，达4706立方米秒，7月开始逐月下降。汛期4～9月径流量占年来水量的74.4％，其中5月占17％，6月占22％。枯水期10月至次年2月径流量占年来水量的17.5％，其中1月仅占3％。
　　闽江的含沙量和输沙量与全国各大河流比较是比较小的。年平均含沙量为每立方米0.132公斤。
　　福州市境内闽江的主要支流有大樟溪和梅溪，此外还有安仁溪、大目溪、尚干陶江、新店溪和营前溪等。闽江水力资源丰富，已在闽清县下濮建成装机容量为140万千瓦的水口水电站。闽江有航运之利，电站兴建前，自福州至南平，可通60吨级轮船；电站建成形成水库后，航运条件大为改善，已可通行500吨级船舶。台江至马尾港可通行千吨级轮船，马尾港至闽江口可通行万吨级轮船。
 
    大漳溪： 闽江下游最大支流。发源于德化县戴云山脉，源头称国宝溪、泸溪，德化县南埕以下始称大樟溪。流经德化、永泰、闽侯3县，于江口注入闽江南港（乌龙江），全长234公里，流域面积4843平方公里，永泰占年平均径流量41亿立方米。 永泰县多山，全市地势最高，山地中又分布着洑口、嵩口、梧桐、赤锡、富泉、城关、台口、葛岭、塘前等盆地，大樟溪在永泰县境内121公里，流经山地和盆地，形成了典型的串珠状河谷，峡谷与盆谷相间排列。大樟溪是山地性河流，

　　河床比降大，纵横交错，集水面积200平方公里以上的支流，有洑口溪、下漈溪、梧桐溪、富泉溪和清凉溪；集水面积50平方公里以上的支流有26条。这些支流的河床比降都很大，蕴藏有丰富的水力资源，可利用水能达38.86万千瓦；塘前至新岐河段可通航30吨级船只。

　　梅 溪： 闽江支流之一，闽清县最长的河流。因绕县城地段遍植梅树，故县城称梅城，溪称梅溪。发源于南部省璜乡莲花山，向北流经省璜、塔庄、坂东、白中、白樟、梅溪、梅城等7个乡镇的56个村，沿途纳岭寨溪、濂溪、文定溪、金砂溪、下泸溪、昙溪等支流，绕县城出溪口汇入闽江，全长78.6公里，流域面积956平方公里，潭口站年平均径流量为8.4亿立方米。梅溪流经山地、丘陵和盆地，形成了串珠状河谷，峡谷与盆谷相间排列。峡谷河段以冲刷作用为主，盆谷地段以堆积作用为主，坂东平原是梅溪流域最大的河谷平原。坂东昔称六都，故为“大大六都洋，小小闽清县（指城关）”之说。梅溪两条较大支流芝溪和金砂溪均分布在梅溪左侧。芝溪发源于后佳，长40公里，流域面积229.4平方公里；金砂溪发溪于闽清与尤溪县交界处的宝坑山，长37.6公里，流域面积180.4平方公里。

　　安仁溪：发源于闽清下祝乡，是闽清北部的主要河流，全长39公里，流域面积为327.65平方公里。

　　大目溪：发源于闽侯雪峰，全长31.3公里，流域面积192.5平方公里。

　　鳌江：连江县最大的河流。发源于古田县东北部鹫峰山脉，由西北向东南流经罗源县西部进入连江县，经小沧、潘渡、鳌江、凤城、浦口、东岱等乡镇，于百胜注入东海，全长137公里（境内长93公里），流域面积2665.3平方公里（境内1224.9平方公里）。主要支流有牛溪和财溪，均位于鳌江左侧，其流向基本与干流平行，次一级支流流向北东，构成格状水系。鳌江为山地性河流，小沧以上的峡谷为主，江面窄，坡降大，水流急；小沧以下，流经贵安、潘渡等盆地，形成串珠状河谷，峡谷与盆谷相间排列。鳌江径流较丰富，年径流量60.5立方米秒，年均径流量27.67亿立方米。水力资源较丰富，可利用水能8.3万千瓦，已建成水仔水电站。水质优良，山仔水库将成为福州市第二饮用水水源。下游便于灌溉和航运，是连江县粮食和经济作物主要产区。潘渡一带山青水秀，又有贵安温泉，宜于发展旅游业。

　　龙江：福州市东部独流入海的水系，福清市最大的河流。发源于莆田县大洋乡瑞云山，自西向东流经东张、宏路、融城，于海口注入福清湾，有太城溪、可路溪、太北溪等支流，全长62公里（福清市境内35.51公里），其中天宝陂至海口长19.75公里，属感潮河段，流域面积538平方公里。天宝陂系唐玄宗天宝年间所建，为拦水工程。1958年上游建东张水库，总库容1.99亿立方米，为福清市工农业和人民生活主要水源。下游水质受海潮影响咸淡交流，多为航运之用，但不宜灌溉。由于气候地形因素，降水量在年际及年内分布不均。汛期在4～9月份，占全年降水量75％，年均径流量约4亿立方米，丰枯年相差量为4.8～3.2亿立方米。洪水主要由台风暴雨造成，最大日降水量达450毫米。

　　太城溪：又称石塍溪，是龙江最大支流；发源于五子岩西麓，向南流经镜洋、宏路注入龙江，长18公里，流域面积81.1平方公里。

　　起步溪：罗源县最长的河流。发源于罗源县北部飞仙岩山，由西向东流经洪洋、起步、凤山注入罗源湾，全长28.6公里，流域面积222.48平方公里。主要支流有护国溪和南门溪。上游流经山地、丘陵，落差大，水流急，水能储藏量达2.67万千瓦；下游流经起步河谷平原和城关，是罗源县粮食作物和经济作物主要产区的灌溉水源。

　　三 溪：闽江口以南独流入海的水系，长乐市东部主要河流。发源于福清市北部大山牳，向北流经江田丘陵区，一支流入文武砂水库注入东海；另一支流入长乐滨海平原的南洋水网。三溪在水网以上长12.4公里，流域面积41.4平方公里。在上游三溪村潘寺岭建有三溪水库，总库容1072万立方米，灌溉面积1866.7公顷
    

　　三十六脚湖： 该湖为天然淡水湖。位于平潭县北厝镇东北、距城关3公里。约5000年前是海坛湾的一部分，由于海陆变迁，演变为泻湖，经淡化成为福建最大的湖泊。

　　湖周长16.5公里，水面2.1平方公里，最大水深16.3米。湖水清澈，是平潭县城生活和工业用水的重要水源。周围海蚀地貌发育，景色绮丽，是著名的风景区之一。