福州市城市轨道交通第二轮建设规划于2015年12月获得国家发展和改革委员会批复。第二轮规划批准建设4号线一期工程、5号线一期工程和6号线，总长度89.3公里。至2021年，形成5条运营线路、总长147.5公里的轨道交通网络。

　　4号线是福州市轨道交通拓展及加密线路，其与轨道交通1、2、5号线共同构成十字、环状网络。4号线工程（一期）全长约24.2公里，为地下线。工程一期计划设22座车站，线路起自洪塘路站，经闽江、杨桥路、东大路、塔头路、前横路、海峡会展中心、濂江村，后下穿南三环路及福峡路后进入螺洲镇。

　　5号线是福州市轨道交通东西向骨架线路，其与轨道交通1、2、4号线共同构成十字、环状网络。5号线工程（一期）全长约24.6公里，为地下线。工程一期计划设20座车站，线路起自淮安，经上下店路、建新北路、金洲北路、金洲南路、盘屿路、义序路（战备路）、欢乐谷、后经规划螺城路、站前大道进入福州南站。

　　6号线是福州市轨道交通东西向骨架线路，起于会展中心站，止于机场站。线路全长40.869km，其中地下线长33.439km，过渡段长0.670km，高架线长6.760km。6号线共设19座车站，其中地面高架站1座，地下站18座。线路基本走向为：会展中心—福泉高速—东部新城—道庆州大桥—203省道—海峡路—郑和路—东鹤路—道庆路—漳江大道—漳港镇—长乐机场，途经东部新城、长乐、滨海新城和福州长乐机场。